１）放線菌和真菌
地表水水源包括水庫中存在有大量的放線菌和真菌，它們在輸配水系統中的非適宜材 料（如橡膠）上也能生長。放線菌和真菌會產生土臭素，２ 甲基異莰醇和其他物質，使飲用水 產生令人討厭的味道和氣味。
２）藍藻和其他藻類
水庫水和河水中藍藻和其他藻類的水華可能會妨礙絮凝沉淀和過濾，使濾后水有顏色 并且渾濁。它們也會產生土臭素、２ 甲基異莰醇和其他化學物質，而這些物質在飲用水中的 味閾值一般只有幾個納克每升。某些藍藻的產物———藻毒素———對健康也有直接影響（見 ８．５．１節），但是藍藻致嗅味物質的產生似乎與藻毒素的產生并無關聯。
３）無脊椎動物活體
無脊椎動物天然存在于許多飲用水供水水源中，常大量滋生于淺灘、開口井等。當顆粒 物屏障不完全有效時，少數無脊椎動物會穿透水處理工藝，從而寄存在過濾或輸配水系統 中。其浮游性使得它們及其幼蟲能夠穿透水廠的濾池和儲水庫的通風孔。
出于控制的目的，無脊椎動物可分為兩個組別。第一組是在水中或水面上自由游動 的生物，諸如甲殼類蚤狀鉤蝦（淡水蝦）、片腳類生物、劍水蚤和圓形盤腸蚤。第二組是其 他無脊椎動物，它們或沿水面活動或定居其中，如水虱、腹足類、斑馬貽 貝、其他雙殼類軟體動物和苔蘚蟲［羽苔蟲］，或 者棲居在黏泥中［如仙女蟲、線蟲和搖蚊幼蟲］。在暖和的天氣里，慢砂濾池 有時能釋放出小昆蟲的幼蟲［搖蚊屬和庫蚊］到水體中。在某 些情況下，這些小昆蟲能進行單性生殖（也就是無性生殖），這會使儲水庫與配水管的問題 惡化。
許多無脊椎動物能通過攝取水中或管道及儲水罐表面淤泥中的細菌、藻類及原生 動物而生存。很少有輸配水系統是完全沒有動物生存的。然而，無脊椎動物群體的密 度和組成差別很大，從重度侵染，包括令用戶討厭的隨時可見的種類，到鮮有出現的微 小種類。
管道飲用水供應商認為溫帶地區無脊椎動物的存在在很大程度上會直接或通過它們與 水變色的關聯造成飲用水可接受性方面的問題。大型無脊椎動物種群還預示著水中高水平 的有機物，這可引起其他水質問題，如微生物繁殖。相比之下，在熱帶和亞熱帶國家，有一些 充當寄生蟲二級宿主的水生無脊椎動物種類。例如，小甲殼類動物劍水蚤是麥地 那龍線蟲的中間宿主（見７．１．１節和１１．４節）。然而，尚無證據證 明麥地那龍線蟲可通過管道供水傳播。飲用水中無脊椎動物的存在（尤其是肉眼可見種 類），會引起用戶對供水水質的擔憂，應加以控制。
當采用快速過濾工藝時，這些動物可穿透水處理裝置和主管網，但即使是運行良好的水 處理廠，也可能產生同樣問題。通過沖洗和／或定期清潔主管網通常可以控制無脊椎動物的 侵染。 對管網配水系統中無脊椎動物侵染的處理詳見支持文件《安全管網水》（附錄１）第６章。
４）鐵細菌 在含有亞鐵和二價錳鹽的水中，鐵細菌產生的氧化（或暴露于空氣）會導致鐵銹色沉積 物沉積在蓄水池、管道和溝槽的壁上，并導致攜帶的沉積物進入水中。
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