醫院污水來源具有多樣性，主要為放射科、口腔科、病例科、手術室、各類檢驗室、洗衣房、食堂等科室和部門排放的印染廢液、放射性污水、含汞污水、洗衣污水及食堂污水等。醫院內不同科室與部門產生的水量及其所含污染物成分各不相同，具體見表1。醫院污水較一般生活污水成分復雜。
水量較小、波動較大，排放不規律，且存在季節性、周期性等差異。夏季排水量較大，其他季節相對較少；工作日排水量大，休息日排水量較小，且晝夜、早晚排放量差距較大。總體而言，醫院的污水量與醫院規模、床位數、就診人數、工作人員人數及季節等因素有關。
醫院污水受到糞便、傳染性細菌和病毒等病原性微生物污染，具有空間污染、急性傳染和潛伏性傳染等特點，可以誘發疾病；醫院污水中含有酸、堿、懸浮固體、COD和動植物油等有毒有害物質；牙科、洗印和化驗等過程產生污水含有重金屬、消毒劑、有機溶劑等，部分具有致癌、致畸或致突變性；同位素和診斷產生放射性污水，危害人體健康。
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