消毒是飲用水處理過程中防范諸多病原體（尤其是細菌）的一個有效屏障，也應該被用 于受到糞便污染的地表水和地下水的處理。剩余消毒劑能夠為應對低水平的污染以及抑制 管網系統中微生物的生長提供部分安全保障。
對受到糞便污染的飲用水供應進行化學消毒能降低致病的總體風險，但這并不足以保 證飲水安全。比如說飲用水的氯消毒對于一些原蟲病原體，特別是隱孢子蟲和某些病毒的 去除效果有限。消毒的效果在有絮狀物和顆粒存在時可能也不盡如人意，因為它們能保護 病原體免受消毒劑的作用。高渾濁度會降低消毒作用對微生物的影響，并促進細菌的生長， 從而大大增加氯的需求。實施整體管理策略是必不可少的，在這個策略中，通過實施多級屏 障（包括原水保護、合適的處理工藝以及存儲和輸配中的保護）并結合消毒措施來預防或者 去除微生物污染。
水處理過程中化學消毒劑的使用常常導 致化學副產物的產生。但是，與消毒不充分 可能引起的風險相比，這些副產物帶來的健 康風險是很小的。重要的是，不能為了控制消毒副產物而犧牲消毒效果。
有些消毒劑，比如氯，作為飲用水的消毒劑能夠很容易對其進行監測和控制。建議使用 氯消毒時進行頻繁的監控。
水處理過程中化學消毒劑的使用常常導 致化學副產物的產生。但是，與消毒不充分 可能引起的風險相比，這些副產物帶來的健 康風險是很小的。重要的是，不能為了控制消毒副產物而犧牲消毒效果。
有些消毒劑，比如氯，作為飲用水的消毒劑能夠很容易對其進行監測和控制。建議使用 氯消毒時進行頻繁的監控。
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